Jerry Allen Coyne (sündinud 30. detsembril 1949) on ameerika evolutsioonibioloog ja geneetik. Ta on tuntud oma kriitikaga intelligentse disaini kohta. Tema raamat "Why Evolution Is True" ('Miks evolutsioon on tõsi') sai bestselleriks.
Ta töötab 1996. aastast Chicago Ülikoolis bioloogiaprofessorina. Tema teadustöö on keskendunud liigitekkele ja seoses sellega evolutsiooniprotsesside uurimisele. Selle teostamiseks teeb ta erinevaid geneetilisi analüüse, et leida ja tuvastada geene, mis toodavad reproduktiivseid tõkkeid Drosophila kärbse erinevate liikide vahel. Ta on avaldanud uurimusi ka populatsiooni- ja evolutsioonigeneetika, ökoloogilise ja kvantitatiivse geneetika alalt ning kromosoomide evolutsiooni uurimise kohta.